Siendo la educación y los procesos pedagógicos vitales para generar comunidades de aprendizaje que puedan suscitar y desplegar procesos de innovación en Nariño, el programa de Innovación Educativa promueve el aprendizaje de métodos y estrategias para desarrollar innovación desde las aulas de clase. La Innovación Educativa propende por generar mecanismos, planes de estudio y contenidos que ayuden a satisfacer la necesidad de aprender sobre el cómo se puede hacer innovación desde los territorios. Toda esta generación de conocimientos está centrada para que sean los niños, niñas, jóvenes y adultos los encargados de dinamizar procesos de innovación social desde sus comunidades, partiendo de contextos inmediatos como la familia, las escuelas, colegios y/o universidades.